一般來說，RFID智能倉庫管理系統的搭建與運行分為軟件設計、硬件架設：
一、 RFID倉庫管理系統軟件設計
依據實際的需要，一般來說設計模塊分為以下幾個方面：
1.入庫管理
當貨物進入到倉庫門口的RFID讀寫器的電磁波范圍的時候，RFID電子標簽將與讀寫器進行通信，將貨物信息傳遞到倉庫管理系統中，通過與訂單的比對核對貨物的數量及型號是否正確。如有不符的情況，系統將會把數據傳輸給現場的工作人員以便進行下一步的比對工作。

2.出庫管理
當貨物運行到倉庫門口時，利用固定式讀寫器與標簽通信，對出庫的貨物的RFID電子標簽采集，并傳送到倉庫管理系統中，檢查是否與計劃對應，如有錯誤，盡快的人工處理。對于少量的貨物，可以使用RFID手持式終端進行RFID電子標簽的信息采集（手持掃描槍或RFID藍牙掃碼器），出現錯誤時，會發出警報，工作人員應該及時的處理，最后把數據發送到倉庫管理系統更新數據庫完成出庫。

3.盤點管理
依據企業的盤點需求，從倉庫管理系統中調出現有數據（包括貨物數量、種類、堆放位置等），工作人員持RFID手持終端機進行貨物盤點掃描（可以一次性完成），同時掃描記錄的數據通過無線網絡傳輸到倉庫管理系統后臺，與原有的數據進行比對發現問題。
除了上述支持RFID技術的讀寫器，倉庫管理系統軟件還包含基本信息管理、系統信息管理、數據統計分析等方面。
二、 RFID倉庫管理系統硬件部署
1.RFID讀寫器部署
RFID倉庫管理系統一般需要將讀寫器天線安裝在倉庫大門的門框以內，一般安裝四個天線，而讀寫器安裝在門旁邊的墻面上。而倉庫內部貨物監測的時候，則需要RFID讀寫器天線放置在不同區域的的頂端，同時將RFID讀寫器也放置在一起。
2.RFID電子標簽的選擇與放置
電子標簽作為倉庫管理系統中的唯一標示，在貼放的時候一定要特別注意。為了獲得最佳的讀寫效果標簽的極化與讀寫器的一定要一致。
同時標簽的材質選擇也一定要正確，如：抗金屬標簽是用于標示金屬貨物的。非抗金屬標簽是用于像木箱、帆布包、塑料袋子、紙箱等貨物，同時注意在粘貼標簽的時候要有一致性不要胡亂粘貼。